Catalyst

El programa Catalyst de Accelrys tiene la capacidad de definir y buscar farmacóforos (patrones) en bases de datos de estructuras químicas tridimensionales de compuestos de interés biológico.

Descripción

Se tienen licenciados los siguientes módulos del programa:

- Visualizer: información, helps, etc. (2 licencias)

- Compare: visualización de estructuras (2 licencias)

- DB-Server: búsqueda en bases de datos

- HypoGen: generación de hipótesis

- HipHop: generación de hipótesis

- Info: creación de bases de datos

- ConFirm: generación de confórmeros

- Shape: búsquedas 3D para identificar substancias con estructuras similares

- HypoRefine: generación de volúmenes de exclusión

Y se dispone de las siguientes bases de datos:

- Available Chemical Directory (ACD): 266.812 compuestos

- Derwent World Drug Index : 48.405 compuestos

- BioByte (Pomona College) : 24.416 compuestos

- National Cancer Institute : 98.868 compuestos

- Maybridge : 47.045 compuestos

- SPECS : 255.000 compuestos

- ChemDiv New Chemistry : 95.209 compuestos

- ChemDiv Discovery Chemistry : 279.117 compuestos

- Jubilant Kinasa : 2.000 compuestos (versión evaluación)

- NatDiverse : 7.046 compuestos

- Aurora : 29.263 compuestos

- IBS : 384.771 compuestos

Catalyst tiene dos motores de búsquedas, el de las estructuras tridimensionales y el de los datos relacionales. El primero funciona sobre una estación de trabajo HP xw8000, mientras que los datos relacionales se encuentran en el servidor de bases de datos HP rp5430.

Para más información, pueden acceder a la página de Accelrys.

Utilización

Es imprescindible que siempre se haga la reserva previa a través del sistema electrónico de reservas.

La interfaz gráfica del Catalyst 4.11 se encuentra instalada en la estación de trabajo HP xw8000 (encantat).

El programa se llama con la instrucción 'catalyst'.

Documentación

En el Centro disponemos del manual Catalyst Tutorials, que es una introducción guiada a las posibilidades del programa. Además, la interfaz gráfica también dispone de un help on line muy completo.