Servicio
de Diseño de Fármacos

El Servicio de Diseño de Fármacos (SDF) es una infraestructura tecnológica que tiene como objetivo atender las necesidades de la investigación en el campo del diseño de fármacos y que ofrece un conjunto de herramientas derivadas de la química computacional que se aplican para predecir, guiar y crear modelos de las moléculas, sus propiedades y sus interacciones, permitiendo así un diseño basado en el conocimiento. Este servicio es innovador ya que engloba tanto a las empresas como a los grupos académicos, lo que facilita la transferencia de tecnología y mejora la competitividad del tejido industrial.
El SDF se puso en marcha en 1996 con una subvención de la CIRIT. A lo largo de los 10 años de funcionamiento, el servicio se ha ido consolidando y en la actualidad la integran tanto grupos industriales como académicos, que constituyen el Grupo de Usuarios del Servicio de Diseño de Fármacos (GUSDF).
Hardware
El servicio se encuentra alojado en un servidor HP Workstation xw8000 con 2 procesadores Intel Xeon a 3,06 GHz, 8 KB de caché L1 y 512 KB de caché L2, 4 GB de memoria principal, 359 GB de disco a 10K y 2 adaptadores GigabitEthernet.
Software
Los usuarios del servicio pueden acceder al siguiente software:
|
– |
Catalyst
(Accelrys) (solamente para usuarios
académicos) |
| – | Sybyl
(Tripos) |
| – | Schrödinger |
Además, se dispone de los siguientes programas de simulación ab initio y dinámica molecular: NAMD, GROMACS y Gaussian, que se pueden ejecutar en los servidores de cálculo disponibles a través del servicio de Supercomputación.
Utilización
El software accesible a través del SDF se puede utilizar accediendo a las instalaciones del Centro (modo local) o bien remotamente a través de la red (modo remoto). En ambos casos siempre es imprescindible que previamente se haga la reserva de los módulos del software que se quiere utilizar a través del sistema electrónico de reservas. Si están interesados en trabajar remotamente, por favor, pueden contactar con nosotros: sdf@cesca.es, para que les informen de los pasos a seguir para configurar sus sistemas.
Acceso al servicio
El acceso al servicio se hace mediante una cuota de alta y una aportación anual que da derecho al uso ilimitado de los diferentes programas. Para más información pueden contactar con nosotros: sdf@cesca.es.

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