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GAMESS 
Gamess (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) es un programa de Química Cuántica, desarrollado en el grupo del profesor M.S. Gordon de la Iowa State University, que permite realizar una gran diversidad de cálculos mecanocuánticos de sistemas moleculares.
Accesibilidad
|
Máquina |
Versiones Disponibles |
Versión Paralela |
Instrucción de llamada |
| Altix
(obacs) |
2008 |
SÍ | gamess2008 |
|
2006 |
SÍ |
gamess2006 |
|
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2005 |
SÍ |
gamess2005 | |
| 2004 |
SÍ | gamess2004 | |
| CP4000
(cadi) |
2008 |
SÍ |
gamess2008 |
|
2006 |
SÍ |
gamess2006 |
|
| 2005 |
SÍ | gamess2005 | |
| NovaScale
(prades) |
2009 |
SÍ |
gamess2009 |
| 2006 |
SÍ | gamess2006 |
En GAMESS están implementados una gran variedad de
métodos para diferentes tipos de cálculos
teóricos:
- Métodos de campo autoconsistente: RHF, UHF, ROHF, MCSCF...
- Métodos Post Hartree-Fock (CI, CC, MBPT) i Teoría del Funcional de la Densidad (DFT)
- Métodos semiempíricos: MNDO, AM1 y PM3
- Cálculo de gradientes y hessianas para la optimización de puntos estacionarios, cálculo de frecuencias, polarizabilidades...
- Métodos de solvatación implícitos y explícitos
- Cálculo de efectos relativistas
- Cálculo de funciones de onda nucleares
- Cálculo de diferentes propiedades moleculares, cargas atómicas, potencial electrostático molecular...
Utilización
Para ejecutar GAMESS, es necesario cargar las variables de
entorno mediante el módulo correspondiente. Se puede
encontrar más información sobre el entorno de
módulos en la sección
Environment Modules.
A continuación el programa GAMESS se ejecuta con el comando de llamada, correspondiente a la versión que se desea utilizar, y un fichero de input como argumento:
A continuación el programa GAMESS se ejecuta con el comando de llamada, correspondiente a la versión que se desea utilizar, y un fichero de input como argumento:
Intrucción_de_llamada input
Para ejecuciones paralelas, podéis consultar en
la documentación (fichero INTRO.DOC del directorio de
cada versión) cuáles son las
metodologías aún no paralelizadas y que
pueden dar lugar a un mensaje de error.
Ejemplos
En el directorio /usr/local/examples
podéis encontrar ejemplos: gamess.lsf i
gamess_parallel.lsf, para enviar trabajos al
batch en
versión secuencial y paralela, respectivamente. Por
otro lado, en el directorio
/prod/GAMESS/gamess$versio/tests hay ejemplos de
ficheros de input para enviar diferentes tipos de
cálculos.
Documentación
La documentación relativa a la descripción del programa, los inputs y más información adicional la podéis encontrar en la página de GAMESS en formato pdf y en el directorio de cada versión con la extensión 'DOC'.
Podéis encontrar más información desde la web de GAMESS.
