primer abans Aula de Noves Tecnologies després últim

2009


Ús i funcionament del sistema d'emmagatzematge NetApp FAS3170
Presentació del clúster de Bull
SIESTA Course. Introductory
Quarta edició del curs de formació per al Repositorio Español de Ciencia y Tecnología (RECYT)
Schrödinger Workshop
Ús i funcionament del sistema d'emmagatzematge NetApp FAS3170 (avançat)
Tripos Workshop
Cinquena edició del curs de formació per al Repositorio Español de Ciencia y Tecnología (RECYT)
INTEUM Training
Entorn de treball i eines de la Química Computacional al CESCA
Schrödinger Presentation
TranSiesta School


• Ús i funcionament del sistema d'emmagatzematge NetApp FAS3170
12 de gener, de 9.30 a 16 hores.

Formació bàsica.

Satec ofereix una formació sobre el nou sistema d'emmagatzematge NetApp FAS3170 per tal que el personal tècnic del CESCA es familiaritzi amb aquest nou equipament. Al curs es tractaran les principals característiques i funcionalitats de la cabina NetApp FAS3170 a nivell de maquinari i d'Ontap, el sistema propietari de NetApp.

Temari:

-
Introducció
-
Funcions de l'Storage Appliance
-
Productes i llicències d'Storage Appliance
-
Protocols d'accés a fitxers (SAN-NAS)
-
El sistema Data Ontap 7.X - configuració bàsica (FilerView-Consola)
-
Fitxers de Configuració
-
Administració de Discos
-
Administració d'Agregats/Volums
-
Administració de Xarxa
-
Administració SAN
-
Clúster


Lloc:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


• Presentació del clúster de Bull
29-30 de gener, de 9.30 a 14 hores.

Bull realitza un curs de formació sobre el funcionament del nou clúster adquirit perquè el personal tècnic del CESCA es familiaritzi amb aquest nou equipament. El clúster està conformat per 56 processadors (de 4 nuclis) a 3,0 GHz, 896 GB de memòria principal i 28 TB en disc; a més de dos nodes per a gestió i accés, cada un d'ells amb dos processadors (de 4 nuclis) a 2,5 GHz, 1,16 TB d'espai en disc i 8 i 16 GB de memòria, respectivament. També, disposa d'una xarxa d'alt rendiment InfiniBand que permet optimitzar el rendiment de les aplicacions moderadament paral·leles.

Temari:

-
HPC architecture
-
XBAS5 overview
-
XVAS5 Installation
-
ClusterDB
-
BSBR alias Mkcdrec
-
BMC/IPMI/Nsctrl
-
Conman/SOL
-
Ksis/Ksis postconfig
-
PDSH
-
Syslog-ng
-
NSMaster
- InfiniBand overview


Lloc:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


• SIESTA Course. Introductory.
19-22 de maig, de 9.00-17.30 dimarts-dijous, de 9.00-13.00 divendres.

Aquest curs farà una introducció teòrica bàsica, incloent la teoria que hi ha darrera de SIESTA (DFT, transport quàntic) i sessions pràctiques (configuració bàsica, tècniques computacionals i analítiques amb SIESTA). Concretament, es tractaran els següents aspectes:


Temari:

-
The theory behind SIESTA:

-
From basic Quantum Mechanics, to Atomic, to Solid State Physics.
-
Basic Density Functional Theory, the Self Consistent Field Loop.
-
Quantum Conduction through molecular scale contacts.

-
The SIESTA Method:

-
The SIESTA basis sets.
-
Order-N.
-
Applicability of the method.

-
Hands-on practical sessions. Basic techniques with SIESTA:

-
Setting up systems (choosing the theoretical model and the configuration).
-
Setting up different configurations: Molecules, Chains, Slabs, Bulks and Open systems.
-
Choosing the theoretical model framework (exchange and correlation functional, computing and using pseudopotentials, ...).

-
Setting up computation-related parameters:

-
Covergence related general parameters.
-
Parameters that affect the computation accuracy for molecules, periodic, and open systems.
-
Tuning parameters that can speed up convergence.

-
Analyzing the output: Numerically and graphically:

-
Energies, Forces, Electronic density, Conductance and transmission spectrum, Mulliken populations, Magnetic polarization, Electrical dipole, Band structures, ...

Per a més informació podeu consultar aquest PDF (Document en PDF, 614 KB).


Material presentacions:

19 de maig
  1. Theory Introduction. Electronic Simulation Basic Concepts of DFT (Document zip, 3,08 MB)
  2. What is SIESTA. The Method and the Program (Document zip, 1,82 MB)
  3. Using SIESTA at CESCA (Document zip, 670 KB)
  4. Theory Pseudopotentials (Document zip, 2,39 MB)
  5. Practical Session. Creating and Testing Pseudopotentials (Document zip, 293 KB)
  6. Theory Molecules (Document zip, 298 KB)
  7. Practical Session. Computing the Stable Configuration of Molecules (Document zip, 1,01 MB)
20 de maig
  1. Theory. Periodic Systems (Document zip, 799 KB)
  2. Practical Session. Periodic Systems (Document zip, 246 KB)
  3. Practical Session: Continued Periodic Systems (Document zip, 246 KB)
  4. Theory. Numerical Convergence Concepts (Document zip, 2,97 MB)
  5. Practical Session. Finding the Converged Total Energy Forces and Bands for Some Simple Systems (Document zip, 1,60 MB)
21 de maig
  1. Theory Technical SIESTA (Document zip, 1,04 MB)
  2. Theory. Open Boundary Systems. Quantum Transport Concepts (Document zip, 3,50 MB)
  3. Practical Session. Setting up Open Systems (Document zip, 0,45 KB)
  4. Theory. Transmission Spectrum and Ballistic Conductance (Document zip, 3,51 MB)
  5. Practical Session. Computing the Transmission Spectrum and Conductance of Some Systems (Document zip, 0,63 KB)
  6. Practical Session Continued. Computing the Transmission Spectrum and Conductance of Some Systems (Document zip, 0,67 KB)
22 de maig
  1. Theory Computing Other Magnitudes Using SIESTA (Document zip, 2,54 MB)
  2. Practical Session. Computing These Other Magnitudes Using SIESTA (Document zip, 0,54 KB)
  3. Practical Session Continued. Computing These Other Magnitudes Using SIESTA (Document zip, 0,58 KB)
  4. Summary of the Course (Document zip, 0,37 MB)
Practical
  1. Practical (Document zip, 17,33 MB)

Lloc:

Edifici Annexus, CESCA


Llenguatge:

Anglès.


Informació:

Per a més informació sobre el curs, podeu contactar amb el personal del CESCA a través de promocioE-mailcesca.cat o 93 205 6464 (ext. 600) o amb l'equip de SIESTA a siestaE-mailuam.es o 91 497 3805.


Organitzen

SIESTA Course


CESCA



• Quarta edició del curs de formació per al Repositorio Español de Ciencia y Tecnología (RECYT)
25-27 de maig, de 9 a 18 hores.

El Repositorio Español de Ciencia y Tecnología (RECYT) és un conjunt de serveis destinats a la comunitat científica espanyola que té per objectiu recolzar la professionalització i internacionalització de les publicacions científiques espanyoles. El repositori compta amb una part pública (Hemeroteca) que permet l'allotjament de revistes científiques de qualitat contrastada i amb una part privada (Edicio de Revistes) que facilita l'ús d'una eina que gestiona l'edició integral de les publicacions. En aquest curs es pretén mostrar el funcionament del repositori i el procés d'edició de les revistes que hi conté.


Lloc
:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Organitza

Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología

Col·labora

CESCA



• Schrödinger Workshop
10-12 de juny, de 9.00-17.00.

Aquest curs, impartit per Schrödinger, descriu les característiques i funcionament d'aquest programari útil per al disseny de fàrmacs. Té una durada de tres dies, als quals hom es pot inscriure per separat, segons les necessitats. Els tres dies incloen teoria i sessions pràctiques. El primer dia consta d'una introducció per a principiants o usuaris que no hagin treballat abans amb el programari d'Schrödinger. El segon i tercer dia estan adreçats als usuaris que coneixen el programari, o als principiants que han assistit el primer dia, i estarà centrat en mètodes basats en l'estructura, alguns mètodes basats en el lligand i la seva aplicació en el disseny de fàrmacs.


Agenda:

10-06-09 Introduction to Maestro and Tips & Tricks
Afternoon session, 14.30 - 17.00


14.30
Arrival and registration

15.00
Introduction to Maestro, a powerfull, all-purpose molecular modelling environment tips, tricks and features in Maestro

17.00
Close

11-06-09 Structure-Based Discovery
All day session, 9.00 - 17.00

9.00
Protein Preparation, SiteMap, Primer Modelling and loop refinement, MD loop refinement

12.00
Lunch break

13.00
Hands-on session for morning topics

17.00
Close

12-06-09 Structure- and Ligand-Based Discovery
Morning session, 9.00 - 15.00

9.00
CombiGlide and Shape-Based Searching

12.00
Lunch break

13.00
Hands-on session for morning topics

15.00
Close




Lloc
:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Llenguatge
:

Anglès.

Inscripcions:

L'assistència és gratuïta, però és necessari inscriure-s'hi ja que les places són limitades. Per formalitzar la inscripció cal que envieu un correu electrònic a Katia.DekimecheAdreça de correu electrònicschrodinger.de indicant a quin o quins dies del curs voleu assistir i les vostres dades personals i de contacte.



• Ús i funcionament del sistema d'emmagatzematge NetApp FAS3170 (avançat)
15, 16 i 18 de juny.

Formació avançada.

Satec ofereix una segona formació sobre el sistema d'emmagatzematge NetApp FAS3170 per tal que el personal tècnic del CESCA complementi la formació bàsica sobre aquest equipament impartida el mes de gener.

Temari:

15 de juny, de 9 a 14 hores.
-
Conceptes generals
-
Descripcions de l'arquitectura d'emmagatzematge
  • Configuració de controladores
  • Connexionat de safates
  • Configuració d'interfícies
  • Arquitectura del clúster FAS3170
  • Opcions globals de configuració
  • Seguretat
  • LDAP
  • Autosupport
-
Administració de filers
-
Configuració de discos
-
Operació amb discos


16 de juny, d'11 a 14 hores.
-
Configuració de volums
  • Definició d'agregats
  • Definició de volums
  • Definició de Qtrees
  • Deduplicació
  • Definició de snapshot
  • Definició de quotes
  • Administració de quotes
-
Configuració de xarxa
  • Configuració d'interfícies de xarxa
  • Configuració de VIF (interfícies virtuals)
  • Configuració de VLAN
  • Fitxers de configuració
-
Configuració NFS
  • Administració NFS


18 de juny, de 9 a 14 hores.
- Configuració MultiStore
  • Definició de Vfiler
  • Definició de volums
  • Opcions de configuració
  • Operacions amb Vfiler
- Configuració SAN
  • Disseny de SAN
  • Administració SAN
  • Definició de LUN
  • Configuració de LUN
  • Administració de LUN
- Monitorització FilerView / CLI
- Anàlisi d'errors - syslog


Lloc:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona



• Tripos Workshop
8 d'octubre, de 9.30-17.30.

Aquest curs, impartit per Tripos, descriu les noves característiques i el funcionament d'aquest programari útil per al disseny de fàrmacs.


Agenda:

9.30
Benvinguda

10.15
Introduction and demonstration of Pantheon, our new platform.

10.45
Descans

11.15
Training on SYBYL, Structure-Based Virtual Screening
Surflex-Dock (protein flexibility, customizing scoring functions, etc.)

14.00
Dinar

15.00
Training on SYBYL, Ligand-Based Virtual Screening
Shape-Based Virtual Screening & R-Group Virtual Screening

17.30
Cloenda



Lloc
:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Llenguatge
:

Anglès.


Inscripcions:

L'assistència és gratuïta, però és necessari inscriure-s'hi ja que les places són limitades. Per formalitzar la inscripció cal que envieu un correu electrònic a secretariaAdreça de correu electròniccesca.cat indicant les vostres dades personals i de contacte.

Podeu trobar més informació en aquest PDF. pdf.gif

Si teniu qualsevol pregunta, no dubteu en contactar amb Teresa Via (promocioAdreça de correu electròniccesca.cat) o Yohan Boursereau (ybourserAdreça de correu electrònictripos.com).



• Cinquena edició del curs de formació per al Repositorio Español de Ciencia y Tecnología (RECYT)
28-30 d'octubre, de 10 a 18 hores.

El Repositorio Español de Ciencia y Tecnología (RECYT) és un conjunt de serveis destinats a la comunitat científica espanyola que té per objectiu recolzar la professionalització i internacionalització de les publicacions científiques espanyoles. El repositori compta amb una part pública (Hemeroteca) que permet l'allotjament de revistes científiques de qualitat contrastada i amb una part privada (Edicio de Revistes) que facilita l'ús d'una eina que gestiona l'edició integral de les publicacions. En aquest curs es pretén mostrar el funcionament del repositori i el procés d'edició de les revistes que hi conté.


Lloc
:

Rafael Hoteles Orense
Paseo del Doctor Vallejo Nájera, 59
28005 Madrid


Organitza

Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología

Col·labora

CESCA



• INTEUM Training
9-11 de novembre, de 9.00-17.00.

INTEUM és un programari de gestió de la propietat intel·lectual que engloba la totalitat de les fases d'aquest procés. Està estructurat en diferents mòduls (registre, protecció i comercialització) i conté altres aplicacions relacionades amb la gestió de patents. En aquesta formació es descriurà el funcionament d'aquest programari, les seves característiques i principals funcionalitats. El curs es dividirà en dos blocs: formació bàsica (9 i 10 de novembre) i formació avançada (11 de novembre).


Agenda:

9 de novembre, The Basics

9.00
General Introduction

Navigation Through Inteum C/S

Document Management

13.00
Lunch break

14.00
Data Management

17.00
Close


10 de novembre, The Basics

9.00
Reports, Reports and More Reports

Financial Management Introduction

13.00
Lunch break

14.00
Basic Activity Management

Correspondence Management

17.00
Close



11 de novembre, Advanced

9.00
Reports, Reports and More Reports

Basic Activity Management

Marketing Managementç

13.00
Lunch break

14.00
Special Features Introduction

Administrative Review

Questions and Answers

17.00
Close


Podeu trobar l'agenda estesa en aquest PDF (Document en PDF, 45 KB)


Lloc
:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Llenguatge
:

Anglès.


Inscripcions:

Aquesta formació està adreçada al Grup de Propietat Intel·lectual (GPI) usuari d'aquest programari al CESCA, però també està oberta a la participació externa. Si esteu interessats en assistir-hi poseu-vos en contacte a través del correu electrònic secretariaAdreça de correu electròniccesca.cat.



• Entorn de treball i eines de la Química Computacional al CESCA
23-24 de novembre.

En aquesta nova edició del curs impartit pel CESCA s'explicarà el funcionament de l'àrea de Supercomputació del CESCA i de les eines i el suport que es posa a l'abast de la comunitat científica per tal de facilitar la seva recerca. Està dirigit principlament a doctorands que s'inicien en la recerca, però també als investigadors que vulguin aprofundir en el coneixement de l'ús dels recursos disponibles. El curs consta de dos mòduls independents, als quals hom es pot inscriure per separat.

El primer mòdul, de caràcter bàsic, donarà una visió general dels recursos disponibles, el seu funcionament i la manera més eficient d'utilitzar-los. Aquesta primera jornada inclourà una sessió de treball amb els tècnics del CESCA on els assistents podran fer les pràctiques que els semblin interessants, contant amb l'ajuda dels tres tècnics de l'àrea de Supercomputació del CESCA. Aquesta sessió va adreçada tant a usuaris novells que vulguin ajuda per començar a calcular a les nostres màquines, com a usuaris avançats que vulguin afrontar, amb la nostra ajuda, problemes particulars que s'hagin trobat.

El segon, orientat específicament a les eines per a la química computacional, començarà amb una introducció als diferents mètodes teòrics. A continuació, s'analitzaran les diverses aplicacions científiques disponibles, incidint en les seves funcionalitats i metodologies. Es donaran les pautes necessàries per iniciar-se en l'ús de cadascuna d'elles.

Aquest segon dia es farà la presentació de la nova versió del Gaussian 09, Rev A.02. Aquesta és la darrera versió del programari, que incorpora un gran nombre de noves funcionalitats en diferents àmbits teòrics i suposa un canvi substancial respecte l'anterior versió (Gaussian 03). D'una banda es presentaran les principals novetats que introdueix aquesta nova versió. De l'altra, hi haurà una sessió general on s'introduirà l'usuari al càlcul amb el Gaussian, especialment en els canvis en aquesta versió. A més, al final de la jornada els usuaris podran provar tant aquesta darrera versió del Gaussian, com qualsevol dels programes disponibles al CESCA, comptant de nou amb el suport dels tècnics del centre.

Aquest curs combinarà sessions teòriques i pràctiques. No és necessari tenir coneixements previs per assistir a cap dels mòduls, però sí que és recomanable tenir nocions bàsiques de UNIX/Linux.

  • Mòdul I: Entorn de treball al CESCA (23 de novembre)
9.30
Entrega de la documentació

9.45
Benvinguda

10.00
Recursos disponibles: descripció del maquinari i programari (Document en PDF, 6,76 MB)

11.00
Descans

11.30
Gestor de cues: LSF (Document en PDF, 797 KB)

13.00
Dinar

14.00
Eines de desenvolupament: compiladors, depuradors i analitzadors (Document en PDF, 840 KB)

15.00
Sessió de treball amb els tècnics del CESCA

18.00
Fi de la primera sessió


  • Mòdul II: Eines per a la Química Computacional al CESCA (24 de novembre)
9.00
Presentació de Schrödinger

10.15
Introducció als mètodes de la química teòrica i computacional (Document en PDF, 1,62 MB)

11.00
Descans

11.30
Programari per a la química teòrica, la biologia i el disseny de fàrmacs (Document en PDF, 1,05 MB)

12.00
Presentació del Gaussian09 (Document en PDF, 2,93 MB)

13.00
Dinar

14.00
Treballant amb el Gaussian09 (Document en PDF, 941 KB)

15.00
Altres programes de química computacional (GAMESS, NWChem, ADF...) (Document en PDF, 1,02 MB)

16.00
Hands-on (Mòdul I Document en PDF, 2,02 MB; Mòdul II Document en PDF, 1,46 MB)

18.00
Fi de la segona sessió


Lloc
:

Sala de Formació
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Ponents
:

Alfred Gil i David Tur, CESCA


Inscripcions:

Aquest curs és gratuït però cal inscriure's, indicant el mòdul o mòduls als que es vol assistir, a secretariaAdreça de correu electròniccesca.cat. La reserva es farà per rigorós ordre d'inscripció, ja que la capacitat de la sala és limitada.



• Schrödinger Presentation
24 de novembre, de 9 a 11 hores.

En aquesta presentació, que impartirà Schrödinger, es presentaran les noves característiques i desenvolupaments de la recent Suite 2009 Schrödinger, i es continuarà amb una sessió de preguntes i respostes específiques per part dels usuaris usant demostracions de Maestro.

Podeu trobar més informació en aquest PDF (Document en PDF, 202 KB)


Lloc
:

Sala de Conferències
CESCA
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Llenguatge
:

Anglès.


Inscripcions:

L'assitència és gratuïta, però és necessari inscriure-s'hi ja que les places són limitades. Per formalitzar la inscripció cal que envieu un correu electrònic a secretariaAdreça de correu electròniccesca.cat abans del 20 de novembre indicant les vostres dades personals i de contacte.



• TranSiesta School
14-16 de desembre.

Des del llançament de la versió 3.0b, el paquet lliure de Siesta inclou TranSiesta. Per això, ara tots els usuaris de Siesta poden efectuar càlculs de transport quàntic ab initio. El correcte ús d'aquesta eina, no obstant, requereix d'uns coneixements específics de conceptes addicionals.

El propòsit d'aquest curs és oferir una introducció específica a l'ús de TranSiesta. S'assumeix que els interessats en assistir-hi tenen coneixements del funcionament del programari Siesta, tant dels aspectes pràctics (preparar un arxiu d'entrada per a un sistema molecular o un sòlid) com d'alguns conceptes teòrics, com ara l'ús de condicions periòdiques de contorn i orbitals atòmics estrictament localitzats.

Aquest curs se centrarà en l'ús del formalisme de les funcions de Green fora d'equilibri (NEGF), en un llenguatge accessible, i en alguns aspectes tècnics de la implementació de TranSiesta. L'objectiu és facilitar la comprensió del procediment general dels càlculs de transport i de les opcions disponibles per als fitxers d'entrada. Finalment, es mostraran alguns casos a mode d'exemple amb diferents característiques del transport i de l'anàlisi que se'n pot fer, incloent sessions pràctiques a l'ordinador.

S'espera que els investigadors assistents al curs adquireixin la suficient familiaritat amb el codi per tal de ser capaços de fer els seus propis càlculs amb seguretat.


Agenda:

El matí del dilluns 14 estarà dedicat a l'entrega de les acreditacions i documentació del curs, i a la configuració dels portàtils per a aquells assistents que usin els seus propis. El curs teòric començarà a les 14.00 h. Podeu trobar l'agenda completa en aquest PDF (Document en PDF, 73 KB).


Professorat de teoria i pràctica:


Dr. Thomas Frederiksen, DIPC, Sant Sebastià
Dr. Frederico D. Novaes (Chair), ICMAB, Barcelona
Prof. Pablo Ordejón, CIN2, Barcelona
Prof. Magnus Paulsson, Kalmar University
Dr. José A. Torres, SIESTA Manager, Madrid


Organitzadors:


Dr. Frederico D. Novaes (Chair), ICMAB, Barcelona
Prof. Magnus Paulsson, Kalmar University
Dr. Thomas Frederiksen, DIPC, Sant Sebastià


Idioma
:

Anglès.


Lloc:

Centre de Supercomputació de Catalunya (CESCA)
Gran Capità, s/n (Edifici Annexus)
08034 Barcelona


Inscripcions:

El curs té un preu de 250 €. Inclou els materials del curs i els coffee breaks. No inclou l'estància que anirà a càrrec de cada assistent.

Per registrar-vos cal que PRIMER ompliu el formulari d'inscripció. Si hi han places disponibles en el moment de fer-ho, rebreu una confirmació per correu electrònic que indicarà els detalls per al pagament del curs. Quedareu oficialment registrats un cop envieu la còpia de la transferència de pagament del curs.


Informació general relacionada amb les sessions pràctiques:

La Sala de Formació del CESCA disposa de 16 PC, cadascun dels quals serà compartit per dues persones durant les sessions pràctiques. Per això, només es pot garantir la disponibilitat de PC per als primers 32 sol·licitants. A més, s'habilitarà una segona sala que podrà ser ocupada per un màxim de 12 persones. Aquells als qui no se'ls pugui proporcionar un PC, hauran de portar el seu propi portàtil per realitzar les pràctiques. Els requeriments mínims del sistema són: 1 GB de RAM i els sistemes operatius Linux, Windows XP o Mac OS (preferiblement Linux).


Informació
:

Hi han diferents residències d'estudiants a Barcelona (www.resa.es/cat/residencias). La més propera a les Instal·lacions del CESCA és la de Torre Girona.

Per a més informació podeu contactar amb F.D. Novaes a ts.school.09Emailgmail.com o amb el personal del CESCA a promocioEmailcesca.cat.


Organitzen

SIESTA Course


CESCA

Aula de Noves Tecnologies

[1996 | 1997 | 1998 | 1999 | 2000 | 2001 | 2002 | 2003 | 2004 | 2005 | 2006 | 2007 | 2008]

Última actualització: TV, 03-11-09 abans tornar després