Catalyst

El programa Catalyst d'Accelrys té la capacitat de definir i cercar farmacòfors (patrons) en bases de dades d'estructures químiques tridimensionals de compostos d'interès biològic.

Descripció

Es tenen llicenciats els següents mòduls del programa:

- Visualizer: informació, helps, etc. (2 llicències)

- Compare: visualització d'estructures (2 llicències)

- DB-Server: cerca en bases de dades

- HypoGen: generació d'hipòtesis

- HipHop: generació d'hipòtesis

- Info: creació de bases de dades

- ConFirm: generació de confòrmers

- Shape: cerques 3D per identificar substàncies amb estructures similars

- HypoRefine: generació de volums d'exclusió.

I es disposa de les següents bases de dades:

- Available Chemical Directory (ACD): 266.812 compostos

- Derwent World Drug Index : 48.405 compostos

- BioByte (Pomona College) : 24.416 compostos

- National Cancer Institute : 98.868 compostos

- Maybridge : 47.045 compostos

- SPECS : 255.000 compostos

- ChemDiv New Chemistry : 95.209 compostos

- ChemDiv Discovery Chemistry : 279.117 compostos

- Jubilant Kinasa : 2.000 compostos (versió avaluació)

- NatDiverse : 7.046 compostos

- Aurora : 29.263 compostos

- IBS : 384.771 compostos

Catalyst té dos motors de cerques, el de les estructures tridimensionals i el de les dades relacionals. El primer funciona sobre l'estació de treball HP xw8000, mentre que les dades relacionals es troben al servidor de bases de dades HP rp5430.

Per a més informació podeu accedir a la pàgina d'Accelrys.

Utilització

Es necessari que sempre es faci la reserva prèvia a través del sistema electrònic de reserves.

La interfície gràfica del Catalyst 4.11 es troba instal·lada a l'estació de treball HP xw8000 (encantat).

El programa es crida amb la comanda 'catalyst'.

Documentació

Al Centre es disposa del manual Catalyst Tutorials, que és una introducció guiada a les possibilitats del programa. A més, la interfície gràfica també disposa d'un help on line molt complet.